Publication: Caracterización del germoplasma de Guadua angustifolia, utilizando microsatélites o SSr Secuencias simples repetidas desarrolladas para arroz.
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Date
2005-02
Authors
Marulanda Ángel, Marta Leonor
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Abstract
La Guadua angustifolia es la especie de bambú más grande e importante de América Tropical; se distribuye desde los 23° Latitud Norte en México hasta los 35° Latitud Sur en Argentina y en un rango que va desde el nivel del mar hasta los 2000 metros.
La guadua es un bambú leñoso, que pertenece a la familia de las Poaceas, ocupa diferentes zonas climáticas de Colombia; en la zona cafetera se encuentra de manera abundante y es considerado como un recurso de mucha demanda por parte del sector productivo, pues es de conocimiento público el potencial que genera en la industria de la construcción y sus derivados
El cultivo de la guadua en Colombia se viene desarrollando hace unos 15 años y tiene uno de los paquetes tecnológicos mas completos del sector forestal, a tal punto que este producto se ha exportado al Ecuador, Costa Rica, Brasil, República Dominicana, México y se está comenzando a exportar a algunos países de Europa como Alemania (Manzano, 2002).
Guadua angustifolia y sus especies relacionadas en Colombia, poseen un grado de variabilidad genética, la cual se expresa a nivel fenotípico, y ha sido posible diferenciarlo estudiando sus características morfológicas, taxonómicas y por observaciones hechas a través de generaciones por comunidades locales. A partir de esta información se han caracterizado y establecido diferentes biotipos de Guadua angustifolia en Colombia como macana, castilla, cebolla, cotuda (Gómez , 1999).
Hasta hoy se han descrito dos variedades de guadua para Colombia: Guadua angustifolia var bicolor y Guadua angustifolia var nigra, de acuerdo con Londoño (1989) y Londoño y Clark (1998) los biotipos macana, cotuda, cebolla y castilla son formas que responden a condiciones de suelo y clima.
El grupo de biotecnología vegetal de la Facultad de Ciencias Ambientales, con el apoyo del Ministerio del Medio Ambiente y Colciencias, ha venido realizando esfuerzos en la caracterización molecular de la variabilidad genética de la Guadua angustifolia, mediante la utilización de marcadores AFLP se ha logrado la diferenciación de especies relacionadas a la Guadua angustifolia y han caracterizado 55 accesiones del banco de germoplasma del Jardín Botánico Juan María Céspedes en Tulúa Valle. Los AFLP permitieron diferenciar e identificar las accesiones de la especie Guadua angustifolia, pero se encontró una variabilidad genética intraespecífica relativamente baja, cuando se comparó con la variabilidad encontrada en las otras especies estudiadas y no fue posible relacionar ningún patrón de bandas con los biotipos o las variedades de la especie (Marulanda et al, 2002).
El presente proyecto se propone continuar el trabajo de caracterizar y cuantificar la diversidad genética en Guadua angustifolia y especies relacionadas en Colombia, mediante la utilización de marcadores moleculares tipo microsatélite o secuencias simples repetitivas. Las secuencias microsatélites son marcadores altamente polimórficos, muy reproducibles, de fácil obtención y de costo relativamente bajo, considerando la información que producen. Estos marcadores se caracterizan por tener un elevado grado de variabilidad molecular; son obtenidos a partir de la amplificación del ADN utilizando PCR, las secuencias resultantes de esta amplificación, siguen una herencia mendeliana simple con carácter codominante, y están distribuidos regularmente en todo el genoma de la especie analizada. En la actualidad las secuencias microsatélites son consideradas como una las fuentes poderosas de polimorfismos para estudios de diversidad genética, llegando a sustituir a la mayoría de marcadores moleculares conocidos hasta el momento, siendo de uso frecuente en la investigación de especies vegetales de interés comercial (Morera,1995; Djé 2000; Liu 2000).
En este proyecto se evaluarán secuencias microsatélites que fueron desarrolladas para elaborar el mapa genético de arroz (Gramene Cornell microsatellite RM markers).