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Biodiversidad y bioinformática: desarrollo de herramientas para el manejo y análisis de datos moleculares de la biodiversidad colombiana.

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dc.contributor.authorBarreto Hernández, Emiliano
dc.contributor.corporatenameUniversidad Nacional de Colombiaspa
dc.contributor.researchgroupBioinformática
dc.coverage.projectdates2004spa
dc.coverage.spatialColombia
dc.date.accessioned2020-10-27T22:08:34Z
dc.date.accessioned2020-12-17T23:58:35Z
dc.date.available2020-10-27T22:08:34Z
dc.date.available2020-12-17T23:58:35Z
dc.date.issued2004
dc.description.abstractDesde una perspectiva ecológica y genética, la biodiversidad es el capital biológico del mundo, representa opciones críticas para su desarrollo sostenible y es vital porque brinda las posibilidades de adaptación a la población humana y a otras especies frente a variaciones en el entorno (GBIF, 2003; Barreto, 2000, Artículo 2, 2000). Colombia es uno de los países donde este tema es parte de la agenda de instituciones gubernamentales y de investigación debido a su mega biodiversidad (en 0.7% de la superficie continental mundial posee cerca del 10% de la diversidad biológica) (Ministerio del Medio Ambiente, Departamento Nacional de Planeación e Instituto Alexander Von Humboldt, 1999; http://www.humboldt.org.co/sib/content.jsp?doc=cifras). La importancia de la biodiversidad, así como la adopción de medidas para su conservación, uso sostenible y distribución de los beneficios que se deriven de su utilización, se consignan en el Convenio sobre Diversidad Biológica y en la Política Nacional de Biodiversidad, lo que implica la generación y organización recopilación de datos biológicos, sistemáticos y moleculares para realizar análisis de forma ágil, eficiente y confiable. En la actualidad la recopilación de la información biológica de forma organizada y sistematizada hace uso de la bioinformática, que ha tenido su auge en el análisis molecular, pero que se ha extendido a áreas como la enseñanza de las ciencias biológicas, a los sistemas para prueba, al desarrollo de nuevos fármacos y más recientemente a la organización y el manejo de los datos sobre biodiversidad, lo que a nivel mundial se ha denominado Informática de la biodiversidad (OECD, 1999, Blum, 2000; Barreto, 2002). En el país existen varias iniciativas para la recopilación de información biológica, dentro de los cuales se pueden mencionar el desarrollo del sistema SPICA (Sistema de Información Biótico Ambiental) del Instituto de Ciencias Naturales de la Universidad Nacional de Colombia y el programa de inventarios del Instituto de Investigación en Recursos Biológicos Alexander von Humboldt (IAvH) sin embargo, es evidente que, con la creciente utilización de técnicas de secuenciación que adelantan los grupos de investigación en Colombia y con el desarrollo e integración de los sistemas para el manejo de datos sobre biodiversidad, las necesidades de herramientas y sistemas que posibiliten la integración y análisis de todos los tipos de datos biológicos disponibles, van a ser cada vez mayores. La información sobre secuencias de ácidos nucleicos y proteínas de organismos nativos de Colombia se encuentra dispersa, cada grupo genera y almacena sus propios datos y sólo parte de ellos se encuentran en los bancos de datos mundiales. Dada esta problemática es necesaria la creación y mantenimiento de un repositorio local con toda la información disponible, que tenga la capacidad de interactuar con sistemas que almacenan otro tipo de información biológica como por ejemplo datos sobre el hábitat nativo, neurobiología, fisiología o relaciones genealógicas de las especies de los cuales provienen los genes (OECD, 1999).spa
dc.format.extent143 páginas.spa
dc.identifier.instnameColcienciasspa
dc.identifier.reponameRepositorio Colcienciasspa
dc.identifier.repourlhttp://colciencias.metabiblioteca.com.cospa
dc.identifier.urihttps://colciencias.metadirectorio.org/handle/11146/39193
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dc.subject.proposalAnfibiosspa
dc.subject.proposalBase de datosspa
dc.subject.proposalBiodiversidad colombianaspa
dc.subject.proposalBioinformáticaspa
dc.subject.proposalCaracterización molecularspa
dc.subject.proposalEleutherodactylusspa
dc.subject.proposalLeptodactylidaespa
dc.titleBiodiversidad y bioinformática: desarrollo de herramientas para el manejo y análisis de datos moleculares de la biodiversidad colombiana.spa
dc.typeInforme de investigaciónspa
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dcterms.audienceEstudiantes, Profesores, Comunidad científica colombiana, etc.spa
dspace.entity.typePublication
oaire.awardnumber11011216782spa
oaire.funderidentifier.colciencias180-2004
oaire.fundernameDepartamento Administrativo de Ciencia, Tecnología e Innovación [CO] Colcienciasspa
oaire.fundingstreamPrograma Nacional en Ambiente, Biodiversidad y Hábitatspa
oaire.objetivesDiseñar e implementar herramientas y modelos bioinformáticos que permitan el almacenamiento, recuperación, análisis e integración de datos moleculares pertenecientes a la biodiversidad colombiana e interrelacionarlos con los datos existentes en la base de datos SPICA. Objetivos específicos 1. Desarrollar e implementar herramientas bioinformáticas para la captura y manejo de datos moleculares de organismos colombianos, disponibles en diferentes fuentes de información. 2. Desarrollar un modelo de base de datos para almacenar los datos acopiados. 3. Desarrollar los sistemas de seguridad, envío, revisión de los datos y mantenimiento en general de la base de datos. 4. Desarrollar interfaces de comunicación con el sistema SPICA del Instituto de Ciencias Naturales de la Universidad Nacional de Colombia, especializado en información morfológica y biogeográfica de organismos nativos. 5. Diseñar e implementar mecanismos de acceso a la información molecular de acuerdo a estándares internacionales, con enlace a los datos morfológicos y biogeográficos del sistema SPICA. 6. Probar la utilidad de las herramientas y bases de datos desarrolladas e implementadas, seleccionando marcadores moleculares que permitan resolver preguntas biológicas en el género Eleutherodactylus.spa

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