Publication: Biodiversidad y bioinformática: desarrollo de herramientas para el manejo y análisis de datos moleculares de la biodiversidad colombiana.
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Date
2004
Authors
Barreto Hernández, Emiliano
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Abstract
Desde una perspectiva ecológica y genética, la biodiversidad es el capital biológico del mundo, representa opciones críticas para su desarrollo sostenible y es vital porque brinda las posibilidades de adaptación a la población humana y a otras especies frente a variaciones en el entorno (GBIF, 2003; Barreto, 2000, Artículo 2, 2000). Colombia es uno de los países donde este tema es parte de la agenda de instituciones gubernamentales y de investigación debido a su mega biodiversidad (en 0.7% de la superficie continental mundial posee cerca del 10% de la diversidad biológica) (Ministerio del Medio Ambiente, Departamento Nacional de Planeación e Instituto Alexander Von Humboldt, 1999; http://www.humboldt.org.co/sib/content.jsp?doc=cifras).
La importancia de la biodiversidad, así como la adopción de medidas para su conservación, uso sostenible y distribución de los beneficios que se deriven de su utilización, se consignan en el Convenio sobre Diversidad Biológica y en la Política Nacional de Biodiversidad, lo que implica la generación y organización recopilación de datos biológicos, sistemáticos y moleculares para realizar análisis de forma ágil, eficiente y confiable.
En la actualidad la recopilación de la información biológica de forma organizada y sistematizada hace uso de la bioinformática, que ha tenido su auge en el análisis molecular, pero que se ha extendido a áreas como la enseñanza de las ciencias biológicas, a los sistemas para prueba, al desarrollo de nuevos fármacos y más recientemente a la organización y el manejo de los datos sobre biodiversidad, lo que a nivel mundial se ha denominado Informática de la biodiversidad (OECD, 1999, Blum, 2000; Barreto, 2002).
En el país existen varias iniciativas para la recopilación de información biológica, dentro de los cuales se pueden mencionar el desarrollo del sistema SPICA (Sistema de Información Biótico Ambiental) del Instituto de Ciencias Naturales de la Universidad Nacional de Colombia y el programa de inventarios del Instituto de Investigación en Recursos Biológicos Alexander von Humboldt (IAvH) sin embargo, es evidente que, con la creciente utilización de técnicas de secuenciación que adelantan los grupos de investigación en Colombia y con el desarrollo e integración de los sistemas para el manejo de datos sobre biodiversidad, las necesidades de herramientas y sistemas que posibiliten la integración y análisis de todos los tipos de datos biológicos disponibles, van a ser cada vez mayores.
La información sobre secuencias de ácidos nucleicos y proteínas de organismos nativos de Colombia se encuentra dispersa, cada grupo genera y almacena sus propios datos y sólo parte de ellos se encuentran en los bancos de datos mundiales. Dada esta problemática es necesaria la creación y mantenimiento de un repositorio local con toda la información disponible, que tenga la capacidad de interactuar con sistemas que almacenan otro tipo de información biológica como por ejemplo datos sobre el hábitat nativo, neurobiología, fisiología o relaciones genealógicas de las especies de los cuales provienen los genes (OECD, 1999).