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Acoplamiento molecular in sillico de los componentes de aceites esenciales con las proteínas del virus del dengue

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col.comunidadvinculadaComunidad científica colombianaes_CO
col.contrato0572-2012es_CO
col.date.proyecto2018-01
col.programa.colcienciasProgramas de CT+I Ejecutados por Redes de Conocimientoes_CO
col.tipo.espGeneración de contenidos impresos, radiales, audiovisuales, multimedia, virtuales y Creative Commonses_CO
dc.audienceAdministradores de ciencia y tecnologíaes_CO
dc.audienceProfesoreses_CO
dc.audienceInvestigadoreses_CO
dc.coverage.spatialColombiaes_CO
dc.creatorPájaro Castro, Nerlis
dc.creatorOlivero Vebel, Jesús
dc.creatorStashenko, Elena E.
dc.creator.corporativoBio-Red-CO-CENIVAMes_CO
dc.creator.corporativoUniversidad Industrial de Santander, UISes_CO
dc.creator.corporativoUniversidad de Cartagena, Unicartagenaes_CO
dc.creator.mailjoliverov@unicartagena.edu.coes_CO
dc.date.accessioned2019-03-31T22:50:15Z
dc.date.available2019-03-31T22:50:15Z
dc.date.embargoEndinfo:eu-repo/date/embargoEnd/2024-01-31es_CO
dc.date.issued2013
dc.descriptionEl virus del dengue (DENV) es un agente infeccioso arboviral, actualmente este no tiene tratamiento específico. El objetivo principal de este trabajo fue evaluar el acoplamiento molecular in silico de los componentes mayoritarios de aceites esenciales con reportada actividad anti-dengue con las proteínas del DENV. Para tal fin las proteínas fueron descargadas de Protein Data Bank (PDB): C, prM, E, NS3, NS5 polimerasa y NS5 metiltransferasa. Los componentes de los aceites esenciales, previamente optimizados, fueron acoplados empleando AutoDock Vina con las proteínas, preparadas y optimizadas. Los valores de afinidad teórica para los componentes de los aceites esenciales sobre las proteínas variaron entre -4.0 y -7.3 Kcal/mol. Las moléculas α-copaeno, β-bourboneno, germacreno D, spathulenol, β-cariofileno, óxido de cariofileno y (+)-epi-biciclosesquifellandreno, todas de naturaleza sesquiterpénica, fueron las que exhibieron la mayor interacción con las proteínas estudiadas. La mayor parte de las interacciones entre estas moléculas y las proteínas DENV fueron de tipo hidrofóbico. Este estudio computacional ha permitido inferir que todas las proteínas del virus del dengue son blancos potenciales para el acoplamiento concomitante de varios compuestos de aceites esenciales.es_CO
dc.description.abstractDengue virus (DENV) is an arboviral infectious agent, this currently has no specific treatment. The main objective of this work was to evaluate the in silico molecular docking of the major components of essential oils with anti-dengue reported with DENV proteins. For this purpose, proteins were downloaded from Protein Data Bank (PDB): C, prM, E, NS3, NS5 polymerase and NS5 methyltransferase. Components of essential oils, previously optimized, were coupled using AutoDock Vina with proteins prepared and optimized. Theoretical affinity values for the components of the essential oils on protein varied between -4.0 and -7.3 kcal/mol. The molecules α-copaene, β-bourbonene, germacrene D, spathulenol, β-caryophyllene, caryophyllene oxide and (+)-epi-bicyclosesquiphellandrene, all of nature sesquiterpene, were those that showed the greatest interaction with the proteins studied. The majority of the interactions between these molecules and proteins were DENV hydrophobic type. This study computational has permitted infer that all dengue virus proteins are potential targets for the concomitant docking of various compounds of essential oils.es_CO
dc.description.isprojectnoes_CO
dc.description.projectid5507-543-31904es_CO
dc.description.projectnamePrograma: Bioprospección y desarrollo de ingredientes naturales para las industrias cosmética, farmacéutica y de productos de aseo con base en la biodiversidad colombianaes_CO
dc.description.sponsorshipDepartamento Administrativo de Ciencia, Tecnología e Innovación [CO] Colcienciases_CO
dc.formatpdfes_CO
dc.format.extent13 páginases_CO
dc.identifier.bibliographicCitationContiene 28 referencias bibliográficas. Véase documento adjuntoes_CO
dc.identifier.urihttp://repositorio.colciencias.gov.co/handle/11146/34162
dc.language.isospaes_CO
dc.relation.ispartofPrograma: Bioprospección y desarrollo de ingredientes naturales para las industrias cosmética, farmacéutica y de productos de aseo con base en la biodiversidad colombiana. La publicación completa está disponible en : <a href="http://repositorio.colciencias.gov.co/handle/11146/34163" target="blank">http://repositorio.colciencias.gov.co/handle/11146/34163</a>es_CO
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/embargoedAccesses_CO
dc.subject.keywordStructural proteins
dc.subject.keywordNon-structural proteins
dc.subject.keywordAutoDock Vina
dc.subject.keywordSesquiterpenes
dc.subject.lembDenguees_CO
dc.subject.lembVectores insectoses_CO
dc.subject.lembVectores patógenoses_CO
dc.subject.lembSesquiterpenoses_CO
dc.subject.spinesBotánicaes_CO
dc.subject.spinesBiología vegetales_CO
dc.subject.spinesQuímica agrícolaes_CO
dc.subject.spinesAceites esencialeses_CO
dc.subject.spinesProteínas estructuraleses_CO
dc.subject.spinesProteínas no estructuraleses_CO
dc.titleAcoplamiento molecular in sillico de los componentes de aceites esenciales con las proteínas del virus del denguees_CO
dc.typeOtroses_CO
dc.type.driverinfo:eu-repo/semantics/other.generacióndecontenidoses_CO
dc.type.hasversioninfo:eu-repo/semantics/draftes_CO
dspace.entity.typePublication

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