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Diagnóstico por PCR en tiempo real y diversidad genética de Pneumocystis jirovecii en Lavado Broncoalveolar y Lavado Orofaríngeo de pacientes inmunocomprometidos, sintomáticos respiratorios. Valle de Aburrá 2000-2009

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dc.contributor.authorVélez Giraldo, Lázaro Agustín
dc.contributor.corporatenameUniversidad de Antioquia (UDEA) (Medellín, Colombia)spa
dc.contributor.researchgroupCOL 0005744 - Grupo Investigador de Problemas en Enfermedades Infecciosasspa
dc.contributor.researchgroupCOL 0013709 - Grupo de Micología Médica y Experimentalspa
dc.contributor.researchgroupCOL 0013746 - Grupo de Microbiología Molecularspa
dc.contributor.researchgroupCOL 0015099 - Programa de Estudio y Control de Enfermedades Tropicalesspa
dc.contributor.researchgroupCOL0004362 - Grupo de Epidemiologíaspa
dc.coverage.projectdates2006-2012spa
dc.coverage.spatialMedellín (Antioquia, Colombia)
dc.date.accessioned2021-09-16T14:18:23Z
dc.date.available2021-09-16T14:18:23Z
dc.date.issued2012-07-10
dc.description.abstractLa neumonía por Pneumocystis jirovecii (PCP) es una infección común en individuos con Síndrome de Inmunodeficiencia Adquirida (SIDA) e inmunocomprometidos por cáncer, transplantes, desnutrición y colagenopatías, entre otras causas. Se estima que su frecuencia aumenta a medida que mejora la sobrevida de las personas susceptibles y se desarrollan terapias inmunosupresoras más potentes. En Colombia la información es limitada, pero los pocos estudios existentes sugieren que hasta el 20% de nuestros pacientes en riesgo sufre PCP. Ésta se diagnostica al visualizar el microorganismo en muestras de lavado broncoalveolar (LBA), pero se requieren otros métodos pues el procedimiento es invasivo y dispendioso, especialmente en niños, y genera aerosoles capaces de transmitir otras enfermedades como tuberculosis. Debido a que P. jirovecii no se ha podido cultivar y es específico de la especie humana, se desconocen muchos aspectos de su biología y epidemiología, lo que ha obligado a desarrollar métodos moleculares para genotipificar el germen.
dc.description.methodsSe estudiarán las muestras de LBA de aproximadamente 300 individuos inmunocomprometidos conservadas a -70ºC en nuestro laboratorio (dentro de las cuales hay cerca de 40 positivas para P. jirovecii), y el LBA y LO de 150 pacientes, también inmunocomprometidos, captados prospectivamente en 2 años. Se incluirán, además, el LBA y LO de 50 personas inmunocompetentes, sometidos a LBA por causas no infecciosas, para un total de 700 muestras. A todas se les harán las coloraciones tradicionales, inmunofluorescencia con anticuerpos monoclonales y PCR en tiempo real. Las positivas se estudiarán por PCR convencional para amplificar 4 genes (ITS1 y 2, mtLSU rRNA, mtSSU rRNA y DHPS) cuyo análisis por SSCP (Single Strand Conformation Polymorphism), DHPLC (Denaturing High Performance Liquid Cromatography) y secuenciación permitirá detectar polimorfismos. La PCR cuantitativa y los distintos genotipos se relacionarán con la presencia de PCP, las características clínico-demográficas de los pacientes afectados, y su evolución con la terapia.spa
dc.format.extent59 páginas.spa
dc.format.mimetypeapplication/pdfspa
dc.identifier.urihttps://repositorio.minciencias.gov.co/handle/20.500.14143/40205
dc.language.isospaspa
dc.publisherUniversidad de Antioquiaspa
dc.publisher.placeMedellín: Universidad de Antioquia, 2021spa
dc.relation.issupplementto111534319142
dc.rightsDerechos Reservados - Universidad de Antioquia, 2021
dc.rights.accessrightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessspa
dc.rights.creativecommonsAtribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0)spa
dc.rights.urihttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/spa
dc.subject.proposalNeumonía en inmunocomprometidos
dc.subject.proposalPCR
dc.subject.proposalPCR en tiempo real
dc.subject.proposalPCR-DHPLC
dc.subject.proposalPCR-RFLP
dc.subject.proposalPCR-SSCP
dc.subject.proposalPneumocystis jirovecii
dc.subject.proposalFactores de riesgo
dc.subject.proposalMortalidad
dc.subject.proposalResistencia
dc.titleDiagnóstico por PCR en tiempo real y diversidad genética de Pneumocystis jirovecii en Lavado Broncoalveolar y Lavado Orofaríngeo de pacientes inmunocomprometidos, sintomáticos respiratorios. Valle de Aburrá 2000-2009
dc.typeInforme de investigaciónspa
dc.type.coarhttp://purl.org/coar/resource_type/c_18wsspa
dc.type.contentTextspa
dc.type.driverinfo:eu-repo/semantics/workingPaperspa
dc.type.redcolhttps://purl.org/redcol/resource_type/INFspa
dc.type.versioninfo:eu-repo/semantics/publishedVersionspa
dcterms.audienceEstudiantes, Profesores, Comunidad científica colombiana, etc.
dspace.entity.typePublication
oaire.accessrightshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2spa
oaire.awardnumber111534319142spa
oaire.funderidentifier.colciencias400-2006
oaire.fundernameDepartamento Administrativo de Ciencia, Tecnología e Innovación [CO] Colcienciasspa
oaire.fundingstreamPrograma Nacional de CTeI en Saludspa
oaire.versionhttp://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85spa

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