Desarrollo de una matriz para espectrometría de masas MALDI (Matrix Assisted Laser Desorption Ionization) basada en sistemas tipo fenilenvinileno.

Combariza Montañez, Marianny Yajaira

Publication:
Desarrollo de una matriz para espectrometría de masas MALDI (Matrix Assisted Laser Desorption Ionization) basada en sistemas tipo fenilenvinileno.

dc.contributor.author	Combariza Montañez, Marianny Yajaira
dc.contributor.corporatename	Universidad Industria de Santander (Bucaramanga, Colombia)	spa
dc.contributor.researchgroup	COL0025709 - Grupo de Química Teórica y Experimental -GIFTEX
dc.contributor.researchgroup	COL0068243 - Grupo de Investigacion en Macromoléculas
dc.coverage.projectdates	2013-2015	spa
dc.date.accessioned	2020-10-26T22:28:20Z
dc.date.accessioned	2020-12-17T23:56:51Z
dc.date.available	2020-10-26T22:28:20Z
dc.date.available	2020-12-17T23:56:51Z
dc.date.issued	2015-04
dc.description.abstract	La ionización/desorción láser asistida por matriz (MALDI) es una de las técnicas más utilizadas en espectrometría de masas para el análisis de biomoléculas (proteínas, ácidos nucleicos, carbohidratos, etc.). El desarrollo de la técnica, hace casi 30 años, dividió la historia de la espectrometría de masas y le significó a su creador el premio Nobel de química en 2002. A pesar del amplio uso de la técnica, el tipo de matrices orgánicas que se usan para asistir el proceso de ionización no han cambiado desde su inicio. Las matrices tradicionales presentan algunos inconvenientes asociados a la formación de clusters en la región de masas bajas, lo cual dificulta el análisis de moléculas de bajo peso molecular; adicionalmente en algunos casos se presenta sesgo ""biass"" hacia algunos compuestos lábiles. Este último problema tiene importantes repercusiones en proteómica, donde la identificación de una proteína depende en gran parte del total cubrimiento de la secuencia cuando se utiliza la metodología ""bottom-up"", que se basa en la fragmentación enzimática de las macromoléculas. Consecuentemente en los últimos años se han desarrollado nuevas matrices para uso en MALDI. Sin embargo, casi todas las nuevas moléculas estudiadas corresponden a variantes del ácido ?-hidroxi-cinámico, la matriz más utilizada en proteómica. En este proyecto, interinstitucional y transdisciplinario donde se conjugan las disciplinas de la química orgánica, teórica y analítica, se propone el desarrollo de nuevas matrices MALDI basadas en sistemas tipo fenilenvinileno. Para orientar la síntesis de las nuevas matrices se utilizará una aproximación de diseño racional, in silico utilizando modelos teóricos, que permita conocer a priori las propiedades de absorción de las moléculas candidatas. Inicialmente las moléculas provienen de la base de datos que existe actualmente el grupo de investigación ""Macromoléculas"", el cual cuenta con una larga trayectoria en la síntesis de compuestos orgánicos basados en unidades de fenilenvinileno con aplicaciones optoelectrónicas. Una vez seleccionadas las estructuras que exhiban mejores características de absorción, energías de ionización y acidez en la fase gaseosa obtenidas mediante las técnicas teóricas, se procederá a su síntesis y caracterización para luego ser evaluadas como matrices MALDI. En este último paso se utilizarán digestiones trípticas convencionales de proteínas como BSA, Mioglobina, y Lisozima para evaluar la eficiencia de la matriz durante el proceso de ionización. Adicionalmente las matrices propuestas se compararán con la matriz estándar MALDI por excelencia, el ácido ?-ciano-4-hidroxi-cinámico (CHCA). En general, la realización de esta propuesta permitirá la obtención de una nueva matriz útil en la ionización de macromoléculas biológicas utilizando la metodología MALDI. En este proyecto interdisciplinario se aprovecharán las fortalezas de los grupos de Investigación: Grupo de Química Teórica y Experimental -GIFTEX de la Universidad Industrial de Santander y Grupo de Investigación en Macromoléculas de la Universidad Nacional de Colombia.	spa
dc.format.extent	15 páginas.	spa
dc.identifier.instname	Colciencias	spa
dc.identifier.reponame	Repositorio Colciencias	spa
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dc.identifier.uri	https://colciencias.metadirectorio.org/handle/11146/39173
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dc.relation.ispartofseries	Informe;
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dc.rights.creativecommons	https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/	spa
dc.subject.proposal	MALDI	spa
dc.subject.proposal	Bottom-up proteomics	spa
dc.subject.proposal	Matriz	spa
dc.subject.proposal	Péptidos	spa
dc.title	Desarrollo de una matriz para espectrometría de masas MALDI (Matrix Assisted Laser Desorption Ionization) basada en sistemas tipo fenilenvinileno.	spa
dc.type	Informe de investigación	spa
dc.type.coar	http://purl.org/coar/resource_type/c_93fc	spa
dc.type.content	Text	spa
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dcterms.audience	Estudiantes, Profesores, Comunidad científica colombiana, etc.	spa
dspace.entity.type	Publication
oaire.awardnumber	110256933793	spa
oaire.funderidentifier.colciencias	0041-2013
oaire.fundername	Departamento Administrativo de Ciencia, Tecnología e Innovación [CO] Colciencias	spa
oaire.fundingstream	Programa Nacional en Ciencias Básicas	spa
oaire.objetives	Desarrollo de una matriz para espectrometría de masas MALDI (Matrix Assisted Laser Desorption Ionization) basada en sistemas tipo fenilenvinileno con aplicación en proteómica.	spa