Publication: Bioactive compounds from microbial cultures.
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Date
2005
Authors
Morales Gutierrez, Esperanza
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Abstract
El presente proyecto esta enmarcado dentro de la alianza estratégica entre la empresa de base biotecnológica Live Systems Technology S.A. y el centro de investigación Corporación Corpogen, y hace parte del proyecto de investigación en cooperación con grupos alemanes aprobado por el programa Nacional de Biotecnología para la identificación de compuestos bioactivos provenientes de microorganismos tendientes al desarrollo de la industria de insumos agropecuarios.
LST S.A., tiene una colección de microorganismos cercana a las 3500 cepas. Estas se encuentran en excelente estado de preservación y determinadas taxonómicamente. La colección cuenta con una base de datos que incluye información fenotípica, ecológica y de actividad biológica. A la fecha, la colección está parcialmente caracterizada desde el punto de vista fisiológico y genético. Las cepas fueron recolectadas de diferentes biotopos colombianos, como por ejemplo: rizosferas de áreas agrícolas de diferentes climas, cuerpos de agua, patógenos de insectos y plantas, etc. Para continuar con el proceso de conocimiento de esta colección y poder explotar su potencial biotecnológico es necesario realizar investigaciones más profundas en los genomas microbianos que permitan en un futuro cercano a desarrollar programas de mejoramiento genético y desarrollo de herramientas de control de calidad de uso a nivel industrial.
En la colección de LST S.A., las especies Beauveria bassiana y Trichoderma harzianum representan dos ejemplos importantes de microorganismos con potencial para el desarrollo de la industria de bioinsumos agropecuarios destinados al control biológico de plagas y enfermedades. Uno de los problemas mas relevantes en esta industria es la falta de estabilidad de las cepas de microorganismos empleadas en la formulación de este tipo de productos, lo que lleva a una baja eficacia de los mismos bajo condiciones de campo. El objetivo principal de este proyecto es identificar cambios en el perfil genético de cepas de estas especies que han mostrado alteraciones en su comportamiento biológico en términos de estabilidad frente a diferentes condiciones ambientales, actividad patogénica, producción de compuestos bioactivos, entre otros. Este conocimiento será base fundamental para futuros desarrollos en la industria de bioinsumos agrícolas.
LST. S.A., suministrará a la Corporación CorpoGen cepas de las especies Beauveria bassiana y Trichoderma harzianum seleccionadas por ellos con base en el conocimiento biológico que tienen de las mismas. Posteriormente, se realizarán ensayos bioquímicos y genéticos que nos permitan eliminar cepas idénticas. Para ello se utilizarán las técnicas de RFLPs, RAPDs e ITSs y sistemas automatizados de identificación bioquímica como: Biolog System (Análisis de utilización de 95 diferentes fuentes de carbono) y el MIDI System (Análisis de perfiles de ácidos grasos). Las cepas que presenten perfiles genéticos idénticos y reacciones bioquímicas iguales serán descartadas para continuar el análisis con las restantes.
Una vez seleccionadas las cepas, se procederá a la realización de una caracterización genética más profunda mediante Southern Blots utilizando secuencias de elementos transponibles que han sido previamente reportados en la literatura. Los posibles sitios de inserción de los transposones serán identificados mediante secuencia de las regiones flanqueantes y la utilización de herramientas de bioinformática. Si no se observan cambios en el perfil genético con los transposones, se empleará una técnica con mayor capacidad de discriminación como el AFLP.
Al final de la investigación esperamos haber identificado cambios en el perfil genético de las cepas que puedan ser correlacionados con diferencias en comportamiento de su actividad biológica.
Los resultados de esta investigación serán publicados en una revista internacional y/ó nacional de reconocido prestigio.