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Diseño de estrategias útiles en la producción estructural de la proteína CagA de Helicobacter pylori partiendo de una caracterización bioinformática y de ensayos de docking molecular.

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dc.contributor.authorJaramillo Henao, Carlos Alberto
dc.contributor.corporatenameUniversidad de los Andes (Bogotá, Colombia)spa
dc.contributor.researchgroupCOL0029429 - Laboratorio de Diagnóstico Molecular y Bioinformáticaspa
dc.contributor.researchgroupCOL0058216 - Grupo de Comunicaciones y Tecnologías de la Informaciónspa
dc.contributor.researchgroupCOL0074599 - Grupo de Diseño de Productos y Procesosspa
dc.coverage.projectdates2012-2015spa
dc.date.accessioned2019-10-11T21:10:02Z
dc.date.accessioned2020-12-18T00:29:51Z
dc.date.available2019-10-11T21:10:02Z
dc.date.available2020-12-18T00:29:51Z
dc.date.issued2015-03-07
dc.description.abstractLa proteína CagA de Helicobacter pylori fue la primera oncoproteína bacteriana en ser identificada como importante en el desarrollo de tumores malignos humanos tales como el cáncer gástrico. No está claro cómo es capaz de desregular mecanismos de control celular para inducir la carcinogénesis después de su translocación a las células epiteliales gástricas humanas. (Apartes del texto).spa
dc.format.extent72 páginas.spa
dc.identifier.instnameColcienciasspa
dc.identifier.reponameRepositorio Colcienciasspa
dc.identifier.repourlhttp://colciencias.metabiblioteca.com.cospa
dc.identifier.urihttps://colciencias.metadirectorio.org/handle/11146/39509
dc.language.isospaspa
dc.relation.ispartofseriesInforme;
dc.rights.accessrightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessspa
dc.rights.accessrightshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2spa
dc.rights.creativecommonshttps://creativecommons.org/licenses/by/4.0/spa
dc.subject.armarcBioinformática
dc.subject.armarcGenética molecular humana
dc.subject.armarcProteínas
dc.subject.proposalOncoproteína bacterianaspa
dc.subject.proposalCagA Helicobacter pylorispa
dc.subject.proposalCaracterización bioinformáticaspa
dc.subject.proposalCaracterización molecularspa
dc.subject.proposalDocking molecularspa
dc.subject.proposalPredicción estructuralspa
dc.titleDiseño de estrategias útiles en la producción estructural de la proteína CagA de Helicobacter pylori partiendo de una caracterización bioinformática y de ensayos de docking molecular.spa
dc.typeInforme de investigaciónspa
dc.type.coarhttp://purl.org/coar/resource_type/c_18wsspa
dc.type.contentTextspa
dc.type.driverinfo:eu-repo/semantics/reportspa
dc.type.redcolhttps://purl.org/redcol/resource_type/PIDspa
dc.type.versioninfo:eu-repo/semantics/submittedVersionspa
dc.type.versionhttp://purl.org/coar/version/c_71e4c1898caa6e32spa
dc.type.versioninfo:eu-repo/semantics/submittedVersionspa
dcterms.audienceEstudiantes, Profesores, Comunidad científica colombiana, etc.spa
dspace.entity.typePublication
oaire.awardnumber1204-521-28554spa
oaire.funderidentifier.colciencias757-2011
oaire.fundernameDepartamento Administrativo de Ciencia, Tecnología e Innovación [CO] Colcienciasspa
oaire.fundingstreamPrograma Nacional en Ciencias Básicasspa
oaire.objetivesObjetivo General : El presente estudio tiene como objetivo establecer un posible modelo estructural de la proteína CagA de Helicobacter pylori partiendo de una caracterización bioinformática y de ensayos de docking molecular con las proteínas encargadas de la señalización: SHP-2 y CsK.spa
oaire.objetivesObjetivos Específicos : 1. Desarrollar una estrategia que permita amplificar el gen completo que codifica para la prote¿na CagA de H. pylori.spa
oaire.objetivesObjetivos Específicos : 2. Caracterizar el gen cagA completo, previamente amplificado.spa
oaire.objetivesObjetivos Específicos : 3. Corroborar la presencia de diferentes motivos de fosforilación tras la caracterización, usando los programas bioinformáticos disponibles, entre ellos el AASA, desarrollado en la Universidad de los Andes, para éste fin.spa
oaire.objetivesObjetivos Específicos : 4. Uso de herramientas de búsqueda de motivos en secuencias biológicas para la confirmación de los motivos de fosforilación presentes.spa
oaire.objetivesObjetivos Específicos : 5. Determinar la estructura terciaria de la proteína CagA usando modelaje por medio de herramientas basadas en homología, ab initio, mecánica y dinámica molecular.spa
oaire.objetivesObjetivos Específicos : 6. Realizar un análisis del efecto de las diferentes motivos EPIYA de CagA sobre la densidad de potencial electroestático, spin y carga para determinar los motivos más propensos a fosforilar o desfosforilar y analizar una posible relación con el grado de patogenicidad de la cepa.spa
oaire.objetivesObjetivos Específicos : 7. Evaluar la afinidad de cada uno de los motivos EPIYA con las señales SHP-2 y CsK por medio de un cálculo de la energía de enlace usando Docking molecular y correlacionar esto con el grado de patogenicidad de la cepa.spa
oaire.objetivesObjetivos Colaterales : El proyecto pretende contribuir a la formación de personal en investigación clínica y a la implementación y consolidación de líneas de investigación multidisciplinarias tanto en biología como en Ingeniería Química, que apoyen el desarrollo y fortalecimiento de proyectos centrados en el área de Diagnóstico y caracterización molecular y el área de Biología computacional y Biología de sistemas que viene liderando el LDMB y el GDPP de la Universidad de los Andes.spa

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