Publication: Identificación y análisis de genes candidatos relacionados con la patogenicidad en Mycosphaerella Fijiensis.
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Date
2017-05-27
Authors
Arango Izasa, Rafael Eduardo
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Abstract
El hongo ascomiceto Mycosphaerella fijiensis es uno de los principales patógenos que ataca los cultivos de banano; es causante de la enfermedad más agresiva dentro del Complejo Sigatoka, la Sigatoka negra (Stover, R.H. y Simonds, 1987). El análisis de este patosistema ha ido adquiriendo un importante interés en el sector bananero debido a que esta problemática causa millones de dólares en pérdidas a los cultivadores, llegando a alcanzar tan solo en Colombia valores de pérdidas de cerca de USD $30 millones por año con un promedio de 25 ciclos de aplicación (Augura, 2010). Además, el uso creciente y extensivo de fungicidas químicos para controlar la enfermedad ha conducido a la contaminación ambiental, afectando la salud humana. M. fijiensis tiene un sistema de adaptación bastante rápido y efectivo a los principales productos químicos de control que existen en el mercado, lo cual ha generado la aparición de cepas del hongo resistentes a tales Quimicos. (Guzmán, M. 2003; Espinal, G. et al., 2005).
Para entender como el hongo enferma la planta y como evade las defensas de la planta es necesario identificar en el genoma de Mycosphaerella fijiensis genes candidatos a determinantes de virulencia y patogenicidad, y determinar si inducen respuestas en plantas resistentes de banano. Para este fin utilizaremos la segunda versión reportada del genoma de Mycosphaerella fijiensis que se encuentra disponible públicamente, a partir de este se explorará la secuencia genómica buscando proteínas putativas secretadas y se analizara la expresión de dichas proteínas mediante microarreglos y PCR en tiempo real. Aquellas proteínas del hongo que se sobre-expresen en contacto con la planta se caracterizarán identificando dominios que indiquen candidatos potenciales de patogenicidad, estos candidatos que demuestren ser interesantes se secuenciarán y caracterizarán en aislamientos de M. fijiensis que varíen en origen geográfico y resistencia a fungicidas para identificar con ayuda del programa PALM4 los genes bajo presión de selección. Posteriormente, algunos de estos genes serán analizados funcionalmente para determinar el grado de incidencia que tienen en la respuesta hipersensible. Este trabajo hace parte de un programa enfocado en mejorar la resistencia de las variedades comerciales de banano a la Sigatoka negra, de esta manera este proyecto permitirá generar conocimiento básico para apoyar el diseño de nuevas estrategias de manejo de la enfermedad como aquellas basadas en la biotecnología. Además, contribuirá con el fortalecimiento científico nacional ayudando a la formación de nuevos científicos en el campo de la Fitopatología, Biología Molecular y Bioinformática.