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Genómica estructural y comparativa del patógeno de yuca Xanthomonas axonopodis pv. manihotis.

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dc.contributor.authorBernal Giraldo, Adriana Jimena
dc.contributor.corporatenameUniversidad de los Andes (Bogotá, Colombia)spa
dc.contributor.researchgroupCOL0013719 - Grupo de Micología y Fitopatología de la Universidad de los Andes
dc.contributor.researchgroupCOL0033092 - Fisiología del estrés y diversidad en plantas y microorganismos
dc.date.accessioned2020-12-10T21:23:06Z
dc.date.accessioned2020-12-18T00:14:57Z
dc.date.available2020-12-10T21:23:06Z
dc.date.available2020-12-18T00:14:57Z
dc.date.issued2008
dc.description.abstractLa yuca constituye la base de la alimentación de más de 600 millones de personas. Es además una materia prima para diversas industrias y actualmente una fuente importante y promisoria de biomasa para la producción de biocombustibles. Una de las enfermedades más limitantes en este cultivo es el añublo bacteriano, causado por Xanthomonas axonopodis pv. manihotis (Xam). Esta enfermedad se podría controlar principalmente a través del uso de variedades de yuca resistentes, ya que las estrategias alternativas de control no han mostrado buenos resultados. Para una óptima y eficiente implementación de la resistencia varietal es necesario conocer las estrategias moleculares por las cuales la bacteria causa enfermedad y la manera en que una planta puede bloquear estas estrategias. Sin embargo, en el momento sólo se conoce un gen que contribuye a la patogenicidad de Xam, de los múltiples que pueden estar involucrados. En los últimos años la genómica estructural y comparativa se han constituido en la ruta más eficiente para conocer las estrategias moleculares de un patógeno. Es así como se han secuenciado varios genomas de bacterias fitopatógenas, incluidas algunas pertenecientes a los géneros Xanthomonas, Pseudomonas y Xyllela. Estos avances de la última década, acoplados con estudios funcionales de los genes encontrados en los genomas, han acelerado de manera sustancial el conocimiento sobre cómo estas bacterias causan enfermedad en sus hospederos. En este proyecto se pretende obtener la secuencia completa del genoma de una cepa colombiana tipo de Xam por medio de estrategias de secuenciación de punta. Posteriormente se determinarán los genes presentes en este genoma por medio de técnicas bioinformáticas y de genómica comparativa y se identificarán genes candidatos a determinantes de patogenicidad. La importancia de estos últimos se analizará por técnicas de biología molecular. La información obtenida se constituirá en un paso considerable en el conocimiento del patógeno, lo que permitirá a futuro generar novedosas estrategias de control. Adicionalmente, este estudio posicionará al país en un punto estratégico a nivel internacional en el área de genómica y bioinformática y en particular en la anotación de genomas.spa
dc.format.extent15 páginas.spa
dc.identifier.instnameColcienciasspa
dc.identifier.reponameRepositorio Colcienciasspa
dc.identifier.repourlhttp://colciencias.metabiblioteca.com.cospa
dc.identifier.urihttps://colciencias.metadirectorio.org/handle/11146/39356
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dc.subject.proposalBacteriosisspa
dc.subject.proposalBioinformáticaspa
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dc.subject.proposalXanthomonasspa
dc.subject.proposalYucaspa
dc.titleGenómica estructural y comparativa del patógeno de yuca Xanthomonas axonopodis pv. manihotis.spa
dc.typeInforme de investigaciónspa
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dcterms.audienceEstudiantes, profesores, comunidad científica colombiana, etc.spa
dspace.entity.typePublication
oaire.awardnumber120445221297spa
oaire.funderidentifier.colciencias264-2008
oaire.fundernameDepartamento Administrativo de Ciencia, Tecnología e Innovación [CO] Colcienciasspa
oaire.fundingstreamPrograma Nacional en Ciencias Básicasspa
oaire.objetivesDeterminar la secuencia del genoma de Xanthomonas axonopodis pv. manihotis para identificar genes implicados en la patogenicidad.spa

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